Invandrarindex har ett nära samarbete med forskare vid olika universitet, bland annat:
- Göteborgs universitet
- Ersta Sköndal Bräcke högskola
- Institutet för Framtidsstudier (Iffs)
- Karolinska Institutet
- Linnéuniversitetet
- Lunds universitet
- Mittuniversitetet
- Stockholms universitet
- Umeå universitet
- Uppsala universitet
